Keep Pet >> Huisdier >  >> honden >> Gedrag

DNA-tests voor honden van gemengd ras

[Bijgewerkt op 10 januari 2019]

De sequentiëring van het hondengenoom, dat in 2004 als openbaar onderzoeksproject werd uitgevoerd, opende de sluizen voor eindeloze mogelijkheden voor genetische tests bij honden. De heilige graal voor veel wetenschappers die zich met dit werk bezighouden, is het begrijpen van en uiteindelijk de eliminatie van erfelijke hondenziekten. Voor veel hondenbezitters is het meest opwindende resultaat van dit serieuze werk echter de mogelijkheid dat ze precies kunnen leren van welk ras hun straathonden zijn gemaakt.

Hoewel er al verschillende commerciële bedrijven zijn die producten aanbieden die beweren precies dat te kunnen doen, is onze beoordeling van de rasidentificatietests dat de resultaten net zo gemengd kunnen zijn als de honden die ze proberen uit te leggen. De testresultaten kunnen bijna net zo gevarieerd, interessant en plezierig zijn als onze gemengde vrienden, maar het lijkt erop dat ze, althans op dit moment, misschien niet in staat zijn om absoluut te voldoen aan de vraag naar de afstamming van uw straathond. De tests worden echter elke dag beter! En naarmate het begrip van DNA, de omvang van de monsterdatabases en de kracht van computers groeien, is het waarschijnlijk dat de tests op een gegeven moment echt zullen voldoen aan de marketinghype die momenteel wordt gebruikt om ze te verkopen.

DNA-tests voor honden van gemengd ras

Hondenrastests:een geschiedenis

De eerste DNA-test met gemengd ras werd geboren in het laboratorium van Elaine A. Ostrander, Ph.D., en Leonid Krugylak, Ph.D., toen ze bij het Fred Hutchinson Cancer Research Center in Seattle waren. Drs. Ostrander en Krugylak waren op zoek naar genetische overeenkomsten tussen rashonden die erkend zijn door de American Kennel Club (AKC). Eén doel was om de genen te ontdekken die verantwoordelijk zijn voor ziekten die zowel bij honden als bij mensen voorkomen, waaronder verschillende soorten kanker. Ze bestudeerden ook de verwantschap van ongeveer 100 van de door de AKC erkende rassen; dit leidde tot de ontdekking dat de genetische variatie tussen hondenrassen veel groter is dan de variatie binnen rassen. Ter vergelijking:de genetische variatie tussen menselijke populaties is ongeveer 5,4 procent; bij honden, ontdekten ze, wordt de variatie tussen rassen geschat op 27,5 procent.

In 2005 ondertekenden Ostrander en Krugylak een commercialiseringsovereenkomst met Mars Veterinary™, een nieuw opgerichte divisie van het machtige Mars, Incorporated (ja, denk aan snoep, kauwgom, voedsel voor huisdieren en andere voedingsmiddelen), waarbij ze een licentie verlenen voor de technologie die ze hebben ontwikkeld voor gebruik in rassen. identificatie.

Mars Veterinary was niet de enige in de race om een ​​rasidentificatieproduct op de markt te brengen. Wetenschappers van MMI Genomics Inc. (MMIG) bestudeerden ook honden-DNA. In feite leverde MMIG identiteits- en afstammingsverificatiediensten voor de AKC, United Kennel Club (UKC), Professional Kennel Club (PKC) en een aantal andere hondenregistraties en rasclubs. MMIG was oorspronkelijk een divisie van Celera en leidde de privé-inspanningen om het hondengenoom te sequensen. Het was ook de eerste die in maart 2007 een rasidentificatietest commercieel op de markt bracht. MMIG noemde zijn product de Canine Heritage™-rastest. Toen het zijn commerciële debuut maakte, kon de test mogelijk slechts 38 rassen identificeren; de test (“XL”) werd medio 2008 geüpgraded om meer dan 100 rassen te identificeren.

DNA-tests voor honden van gemengd ras

Mars Veterinary bracht zijn test slechts een paar maanden later, in september 2007, op de markt als de Mars Veterinary Wisdom Panel™ MX-test.

Hoe werken DNA-tests bij honden?

Elk bedrijf promoot zijn tests door te zeggen dat het een goede manier is voor hondenbezitters om te weten te komen of zijn of haar hond vatbaar is voor een bepaalde genetisch gekoppelde ziekte als de hond rassen heeft waarvan bekend is dat ze bepaalde aandoeningen erven. Ze zeggen ook dat de tests helpen bij het trainen, door de eigenaar inzicht te geven in het gedrag van de hond; de reden waarom de hond handelt zoals hij doet, kan worden verklaard door zijn achtergrond. Aan het eind van de dag geven bedrijfsvertegenwoordigers echter toe dat de meerderheid van hun klanten de tests gewoon uit nieuwsgierigheid en omdat het leuk is om te doen, koopt.

De DNA-tests die we hebben bekeken, putten hun database uit de meer dan 160 rassen die door de AKC zijn erkend en hebben alleen betrekking op de rassen die in Noord-Amerika worden gevonden. Wereldwijd zijn er naar schatting meer dan 300 hondenrassen.

De tests gebruiken genetische hulpmiddelen die "markers" worden genoemd om het concept van een hondenras te definiëren. Een genetische marker is een positie in het genoom waar er variabiliteit is in de sequentie die wordt geërfd, volgens de regels van de klassieke genetica. Twee veelvoorkomende soorten markers zijn microsatellieten en single nucleotide polymorphisms (SNP's).

Elk bedrijf ontwikkelde onafhankelijk een reeks markeringen die de rassen in hun databases definiëren en gebruikt geavanceerde computeralgoritmen om het DNA van een bepaald gemengd ras te matchen met dat in de database om de beste rasmatch(s) voor hem te vinden. De analyse bepaalt hoe nauw en in welke mate de genetische patronen van de hond van gemengd ras overeenkomen met die van raszuivere honden.

Er zijn twee zeer belangrijke spelers op de Amerikaanse markt (MMIG en Mars Veterinary) en een paar die proberen een grotere rol te spelen. EDP ​​BioTech Corp. is erg nieuw; een vierde bedrijf, DNA Diagnostics Center Veterinary, besteedt zijn werk uit aan EDP BioTech Corp. Er is ten minste één test (Viaguard DNAffirm™) aangeboden door een Canadees bedrijf, Accu-Metrics Ltd., die we niet hebben onderzocht.

Mars Veterinary Wisdom Panel™

De Wisdom Panel MX was de enige DNA-test van gemengd ras waarvoor een bloedmonster nodig was. In eerste instantie alleen beschikbaar via dierenartsen, is de test nu direct online beschikbaar bij Mars Veterinary, evenals bij dierenartsen en geselecteerde dierenspeciaalzaken. Het heeft een adviesprijs van $ 125, inclusief gratis verzending als deze rechtstreeks bij Mars Veterinary wordt besteld. Desalniettemin is een reis naar de dierenarts van uw hond nog steeds noodzakelijk voor een bloedafname, wat extra kosten betekent voor het bezoek en de procedure van de dierenarts, en mogelijke stress voor uw hond als hij niet van de dierenartspraktijk houdt.

De AKC erkent 161 rassen; de Mars Veterinary-database bevat 153 AKC-rassen in zijn database, plus vier rassen die wachten op erkenning door AKC, voor een totaal van 157 rassen. Om zijn database te ontwikkelen, typte Wisdom Panel meer dan 13.000 honden tijdens de ontwikkeling van de test, waarmee meer dan 19 miljoen genetische markeranalyses werden voltooid. De database van Mars Veterinary is de grootste van de drie bedrijven die we hebben onderzocht, maar de test is ook de duurste.

Na het extraheren van DNA uit het bloedmonster, worden enkele SNP's - of kleine variaties in DNA-opmaak - geïdentificeerd. De test onderzoekt 321 punten of markeringen waar variaties worden gevonden, op zoek naar rasspecifieke patronen. Er wordt dan een eigen algoritme op de gegevens uitgevoerd.

Angela Hughes, DVM, een veterinair geneticus en adviseur voor Mars Veterinary, legt het uit door te zeggen dat de computer vervolgens "zegt" terwijl hij naar het DNA van een bepaalde hond kijkt:"Als ik haar één ding moet maken, wat zou dan het beste zijn wedstrijd? Als twee, wat zou ze overeenkomen, dan drie, dan zo verder, tot acht. Het resultaat is dan een statistische score voor elke 'boom' die het programma bouwt over hoe die hond het beste bij elkaar past." Acht is het magische getal, aangezien het betrouwbaarheidsniveau van Mars Veterinary drie generaties teruggaat (acht overgrootouders).

Het bedrijf beweert dat de test de samenstelling van het ras bepaalt met een nauwkeurigheid van 90 procent, en definieert dat als een validatietest die heeft geresulteerd in een gemiddelde nauwkeurigheid van 90 procent bij eerste generatie gekruiste honden van bekende afstamming (onze nadruk).

Net als bij de concurrerende Canine Heritage-test, worden de resultaten van het Wijsheidspanel gerapporteerd in drie categorieën, alleen Mars Veterinary noemt ze Significant, Intermediate en Minor rassen, ruwweg vertaald naar ouder, grootouder en overgrootouder. Om een ​​ras als significant te vermelden, moet ten minste 50 procent van het DNA van de hond afkomstig zijn van dat ras (d.w.z. een van de ouders was een raszuivere of mogelijk beide grootouders waren van hetzelfde ras); Gemiddeld, minimaal 25 procent; en Minor, ten minste 12,5 procent.

Mars Veterinary verwacht dat als uw hond een significant ras vertoont, hij waarschijnlijk enkele fysieke en gedragskenmerken van dat ras zal vertonen, tenzij sommige genen recessief zijn. Voor Intermediair ziet u mogelijk enkele fysieke en gedragskenmerken van dat ras bij uw hond, en voor Minor is het onwaarschijnlijk dat de fysieke kenmerken van het ras visueel worden weergegeven in de hond, tenzij sommige genen dominant zijn.

Het bedrijf citeert een doorlooptijd van twee tot drie weken op de testresultaten; teststatus kan online worden gevolgd - en resultaten, wanneer klaar, worden naar de klant gemaild, maar zijn eerder online beschikbaar. De enige contactgegevens van het bedrijf die op de website worden aangeboden, is een e-mailadres; hoe nutteloos dat ook is, de website zelf biedt tonnen informatie.

Toen we een telefoonnummer vonden om het bedrijf te bereiken, was de vertegenwoordiger die antwoordde redelijk behulpzaam, hoewel hij meer bereid was om te gaan met iemand die belde om de testresultaten van hun hond te bespreken dan met iemand die diepgaande informatie over het bedrijf en zijn producten.

Bekijk hier de producten van Wisdom Panel.

BioPet Vet Lab / PooPrints

De laatste nieuwkomer op de markt is de DNA Breed ID Test aangeboden door BioPet Vet Lab, een divisie van EDP Biotech Corp. BioPet Vet Lab zelf werd eind 2007 opgericht; de honden-DNA-test werd begin 2008 gelanceerd via online wederverkopers. Naast de ras-ID-test biedt BioPet ook DNA-bewijs van afstamming, DNA-huisdier-ID en het zeer interessante PooPrints™-programma ("match the mess through DNA").

Het doel van het bedrijf is om een ​​degelijke, betaalbare test aan te bieden. Het hoopt dit te bereiken door het aantal rassen in zijn database te beperken tot 63 - wat volgens het bedrijf "ongeveer 93 procent van het honden-DNA vertegenwoordigt dat in de VS is volgens historische trends in de populariteit van het ras" - en de test te prijzen op $ 60 . Het toevoegen van extra rassen vereist het toevoegen van meer markeringen, wat de kosten verhoogt; BioPet suggereert dat het hoogstwaarschijnlijk zijn database zal overtreffen bij 65 tot 70 rassen. Ook deze test gebruikt een wanguitstrijkje om het DNA van een hond te verzamelen.

Het bedrijf verkoopt zijn tests via PetSmart, Pet Supermarket, andere retailers en online retailers. De doorlooptijd voor resultaten is ongeveer twee weken en het lijkt erop dat het bedrijf geen online trackingmogelijkheid heeft voor de teststatus. Ze zullen op verzoek een test opnieuw uitvoeren, waarbij ze de mogelijkheid van menselijke fouten erkennen, maar bedrijfswoordvoerder Meg Retinger meldde dat zelfs bij de tests die ze opnieuw hebben uitgevoerd, ze nog nooit een testresultaat hebben gezien dat bij de tweede run compleet anders was. De BioPet-website bevat een matige hoeveelheid informatie en de woordvoerder van het bedrijf was behulpzaam.

Gelukkige consumenten van DNA-tests voor honden van gemengde rassen

Ruby, genoemd naar haar korte rode jas, werd thuisgebracht bij Rosalie en Leonard Sanchez uit Riverside, Californië, door hun 15-jarige kleinzoon, die haar kreeg van een dame die puppy's gaf vanaf de achterkant van een pick-up truck. De dame vertelde hun kleinzoon dat de pup een St. Bernard mix was. Rosalie verwierp zijn woorden snel, in de veronderstelling dat hij dat deel van het verhaal verzonnen had, omdat Ruby helemaal niet op een Sint-Bernard leek.

Begin dit jaar hoorde ze over de Canine Heritage-test en was ze benieuwd naar Ruby's achtergrond. Zij en haar man vermoedden dat Ruby deels Boxer was. Hun dierenarts was het daarmee eens, vanwege Ruby's grote poten; zijn gok was Boxer/Great Dane of Boxer/Mastiff.

Toen de resultaten terugkwamen, was Rosalie gevloerd; haar kleinzoon had toch gelijk! De test toonde Boxer en St. Bernard. Hoewel ze er nog steeds niet over uit kan dat Ruby niet op een Sint-Bernard lijkt, zegt Rosalie:"Een hond van gemengd ras is als een doos chocolaatjes. Je weet nooit wat er aan de binnenkant zit.”

De vriendin van Dan McCarthy vond Flora naast een bushalte, uitgemergeld en onder de vliezen. Hun dierenarts dacht dat Flora een mix van Labrador en Springer Spaniel was, maar ze was aan de kleine kant en woog op tweejarige leeftijd 30 pond. Andere mensen vermoedden Border Collie en Jack Russell Terrier.

Dan, een inwoner van Hollywood, Californië, wilde zoveel mogelijk over Flora weten. "Ik wil weten wie haar vader en moeder waren, waar ze nu zijn, en ze laten zien dat Flora is uitgegroeid tot een geweldige hond met een geweldig leven", zegt hij. Afgelopen zomer bestelde hij de Canine Heritage-test. De resultaten toonden aan dat Flora's ouders waarschijnlijk geen raszuivere dieren waren - niets vermeld in de categorie Primair, precies zoals Dan had vermoed. Het secundaire niveau meldde echter Duitse herder en cocker-spaniël. Daan was verbaasd. "De spaniël legt uit waarom ze zo klein is en de herder legt uit waarom ze zo slim is!"

Kitty Cannon uit Crystal Beach, Florida, en haar man hadden altijd een raadspel gespeeld over de make-up van hun hondenras. Toen ze in 2008 hoorden over DNA-testen, dacht Kitty:"Waarom niet? Omdat we het ons niet kunnen veroorloven om Fox te laten klonen, kunnen we misschien door zijn rassen te kennen in de toekomst op zoek gaan naar een andere geweldige hond met zijn eigenschappen.” Ze vermoedden dat Fox deels een Collie of Sheltie was. Toen hun Canine Heritage-resultaten terugkwamen, waren ze verrast om Berner Sennenhond in de secundaire categorie en Chow Chow "In the Mix" te krijgen. Alleen een hoger wezen zou zeker weten of de resultaten kloppen, zegt Kitty, "maar we merken wel enkele overeenkomsten op met betrekking tot waar hij zijn vachtkleur, oorvorm en kaaklijn kreeg. We weten dat ze de mal met hem hebben gebroken en dat er nooit meer een zal komen.”

Evelyn Orenbuch, een dierenarts uit Philadelphia, bestelde het Mars Veterinary Wisdom Panel MX voor haar reddingshond, Pia. “Ik wilde weten of het gedrag van Pia iets te maken had met de rassen waarvan ik dacht dat ze die in zich had. We raadden Border Collie, Whippet en…?” De resultaten kwamen alleen overeen op de laagste niveaus en onthulden de Duitse herder en een aantal andere rassen. Dr. Orenbuch was enigszins teleurgesteld, omdat ze had gehoopt meer informatie te hebben over Pia's afkomst. Desalniettemin zegt ze dat ze de test aan klanten zou aanbevelen. “Als je weet welke rassen je hond heeft, kun je zijn emotionele en fysieke aspecten begrijpen. Het verandert misschien niets aan wat u met uw hond doet of hoe u hem behandelt, maar het kan u wel helpen hem te begrijpen.”

Kritiek en beperkingen bij het testen van rassen

Het Wijsheidspanel (Mars Veterinair product) is bekritiseerd omdat het een reis naar een dierenarts en een bloedafname vereist. Dit verhoogt de testkosten en kan honden die afkerig zijn van dierenartsen stress geven. Critici suggereren ook dat bloedmonsters tijdens het transport naar het laboratorium kunnen worden beschadigd.

Mars Veterinary verdedigt zijn beslissing om bloed te gebruiken door uit te leggen dat DNA uit een bloedmonster de "gouden standaard" is, aangezien de kwaliteit en kwantiteit van het verkregen DNA beter is dan van een wanguitstrijkje. Dr. Hughes van Mars Veterinary zegt dat het DNA in bloed eigenlijk erg winterhard is, en in feite moet het laboratorium de temperatuur van het DNA herhaaldelijk tot bijna kokend verhogen tijdens de SNP-analyses. Het bedrijf gebruikt ook speciaal ontworpen plastic buisjes om de bloedbuis tijdens het transport te beschermen.

Wanguitstrijkjes testen krijgen hun eigen kritiek. Buccale swabs hebben een hoger percentage mislukkingen als gevolg van variatie in de bemonstering van de eigenaar, zoals het niet verzamelen van voldoende cellen. Vanwege bacteriën in de mond van honden is er ook kans op bacteriegroei als de monsters niet correct worden behandeld.

Dan is er kritiek van consumenten. Een terugkerend thema van ontevreden klanten is dat de resultaten van een DNA-test geen overwicht van een bepaald ras konden vinden bij hun "zeer gemengde gemengde" honden. (Zie secties hieronder.)

Een andere heeft te maken met het feit dat sommige honden helemaal niet lijken op de rassen die hun tests hebben gedetecteerd. Het is moeilijk om je goed te voelen over een resultaat dat niets bevestigt of verklaart over het fysieke uiterlijk of gedrag van de hond - en de verklaringen van de bedrijven voor dit fenomeen kunnen onbevredigend zijn.

De Wisdom Panel-website zegt:"Veel delen van het hondengenoom zijn waarschijnlijk niet waarneembaar of verborgen met betrekking tot het bepalen van eigenschappen. Dit kan gebeuren voor een willekeurig aantal eigenschapbepalende genen. Simpel gezegd, een hond van gemengd ras kan een mix zijn van drie of vier rassen, maar heeft weinig kenmerken die duidelijk zijn uit een of meer van deze rassen.”

MMIG's legt uit:"Canine Heritage Breed Test werkt alleen voor de rassen die zijn gevalideerd. Als de rassamenstelling van uw huisdier niet-gevalideerde rassen bevat, kan de test rassen identificeren eerder in de voorouders van uw hond. Dit kan leiden tot identificatie van ogenschijnlijk onwaarschijnlijke rassen voor de samenstelling van uw huisdier. Hoe valide zijn de resultaten?

Om enig perspectief te krijgen van een onafhankelijke expert op het gebied van honden-DNA, interviewden we Beth Wictum, directeur van het Veterinary Genetics Laboratory van de University of California-Davis School of Veterinary Medicine. Wictum werkt al 30 jaar bij de universiteit. Ze heeft deelgenomen aan en was getuige van de evolutie van de wetenschap die het mogelijk maakt om een ​​dier te identificeren door middel van de studie van zijn weefsel; tijdens haar ambtstermijn is 'state of the art' van bloedtypering naar genoomsequencing gegaan.

Gevraagd om commentaar te geven op ID-tests van gemengde rassen, benadrukte Wictum dat de tests slechts zo goed zijn als de database van elk bedrijf; dat wil zeggen, als een ras niet is vertegenwoordigd in de database van een bedrijf, zal de test de volgende dichtstbijzijnde match identificeren. Ze legt uit door te zeggen dat rashonden, vooral geregistreerde rashonden, intensief worden beheerd en een beperkte genetische pool hebben.

"De meeste rassen zijn de afgelopen paar honderd jaar door intensieve selectie ontstaan, dus er is niet genoeg tijd geweest om door mutaties te divergeren", zegt ze. De verschillen tussen rassen zitten in het selectief fokken door fokkers op morfologie (structuur) of gedrag. Daarom zou de ideale rastest er een zijn die kijkt naar die eigenschappen die elk ras kenmerken en ze uniek maakt.

“Het veld van hondengenetica is nog jong; het hondengenoom werd pas ongeveer vijf jaar geleden gesequenced, "zegt ze. "We beginnen net de genen te identificeren die verantwoordelijk zijn voor verschillende eigenschappen."

Zoals veel wetenschappers op dit gebied, is Wictum enthousiast over het potentieel om de genetische basis voor verschillende ziekten te identificeren. Ze zegt dat het Veterinary Genetics Laboratory van UC Davis en het Bannasch Laboratory (ook van UC Davis) “de genetische basis van verschillende ziekten identificeren, die vervolgens als tests aan het publiek kunnen worden aangeboden. Als je weet welke ziekten kunnen optreden, kun je je huisdier laten testen om te zien of hij de mutatie draagt.”

Haar advies over de DNA-testen van gemengde rassen? "Hoewel deze tests kunnen wijzen op rassen die hebben bijgedragen aan de genetische samenstelling van uw huisdier, moet u zich realiseren dat ze niet 100 procent nauwkeurig zijn - en ik denk niet dat ze beweren dat te zijn. Als je het geld te besteden hebt en het gewoon voor de lol wilt doen, ga je gang en doe het.”

Sommige eigenaren zeggen dat rastesten het niet waard zijn

Laura Pescador uit Denver, Colorado, bestelde de Canine Heritage-test voor Misha, haar "60-pond, zwart en bruin, vierkante neus, kortharige, grote oren, diepe bovenlijf, bi-eyed mystery mix" in mei 2008 Laura vond de rascombinatie die haar werd verteld toen ze Misha adopteerde onwaarschijnlijk (Australian Shepherd/Labrador Retriever); ze hoopte ook een stuk papier te ontvangen waarop stond dat Misha geen pitbull-mix was:"Niet omdat ik ze niet leuk vind, maar vanwege de rasspecifieke wetgeving van mijn stad." Laura was teleurgesteld toen ze een "verontschuldigingsbrief" ontving met de resultaten dat de test niet overtuigend was! Op haar certificaat stond naast 'Primair' 'Ongetest ras', terwijl de andere twee categorieën blanco waren.

Scamper, Monty en Rainey zijn drie honden van gemengd ras die toebehoren aan dierenarts J.C. Burcham, uit Olathe, Kansas. Begin 2008 diende ze voor elke hond bloedmonsters in voor de Wisdom Panel-test. Dr. Burcham was er vrij zeker van dat Monty "verschillende generaties straathonden fokte op straathonden" en had weinig verwachtingen van zijn resultaten. Ze noemt Scamper een Jack Russell/Basenji/Beagle-mix, dus verwachtte ze zoiets te zien, of zelfs een terriërras. Rainey werd als puppy gevonden op het platteland van Virginia, uitgehongerd met twee nestgenoten, die alle drie op Border Collies leken.

Toen de resultaten binnenkwamen, was Dr. Burcham teleurgesteld. “Ik had het gevoel dat het een complete verspilling van geld was! Rainey is duidelijk een Border Collie, en dat was ongeveer het enige betrouwbare resultaat dat ik zag. Twee van mijn drie honden bleken "te complex" te zijn om te identificeren. Dat had ik je kunnen vertellen! Daarom heb ik voor de test betaald.” Rainey's resultaten toonden "enige" Border Collie; ze vertoonde echter verre sporen van Briard, Cairn Terrier, Great Dane en Keeshond. Monty's test onthulde sporen in de verte van Alaskan Malamute, Beagle, Bearded Collie, Chow Chow en Smooth Fox Terrier, terwijl Scamper's sporen van Briard, Curly-Coated Retriever en Shetland Sheepdog vertoonde.

Dr. Burchams grootste teleurstelling was het zien van Briard in twee van haar honden, wat volgens haar onwaarschijnlijk was. Ze was ook geïrriteerd dat Scamper en Monty 'extreem complexe honden van gemengd ras' werden genoemd. Met slechts 10-15 procent van de honden van gemengd ras die in die categorie vallen (volgens Mars Veterinary), hoe kon ze er dan twee hebben?

Ik deelde de teleurstelling van Dr. Burcham met Dr. Hughes, de Mars Veterinary consultant, en ze bood aan om niet alleen naar de drie tests te kijken, maar ook om ze opnieuw uit te voeren. In het jaar sinds dr.
Burcham heeft de monsters ingediend, 23 extra rassen zijn toegevoegd aan de Mars Veterinary-database en de algoritmen zijn aangepast. Het bedrijf had ontdekt dat het programma honden opsplitste in veel kleine stukjes, "het bos door de bomen verloren", wat resulteerde in een aantal valse positieven. De resultaten zijn nu meestal een kleiner aantal rassen en mogelijk in grotere "bedragen".

Toen Rainey's test opnieuw werd uitgevoerd, verschenen Briard en Cairn Terrier niet; ze waren hoogstwaarschijnlijk vals-positieven geweest. Border Collie stootte tot het niveau Significant (ouder) en Great Dane en Keeshound kwamen op het niveau Intermediair (grootouder). Monty's resultaten toonden aan dat Beagle en Chow naar het gemiddelde (grootouder) niveau gingen; de andere rassen waren nog steeds duidelijk, maar konden niet met vertrouwen worden genoemd, dus waren ze waarschijnlijk vals-positieven in de eerste test.

De nieuwe resultaten van Scamper onthulden nog steeds een "zeer gemengde hond". Curly-Coated Retriever ging naar het Intermediate (grootouder) niveau en Golden Retriever verscheen op het Minor-niveau. Briard en Sheltie maakten mogelijk deel uit van haar verre geschiedenis of valse positieven. Er werden ook Anatolische herder en Australian Cattle Dog gedetecteerd, die volgens Dr. Hughes waarschijnlijker waren dan Briard en Sheltie.

Nancy Kerns weegt mee

Toen auteur Lisa Rodier het idee voorstelde om een ​​artikel te schrijven over de identificatietests van gemengde rassen, [ wilde natuurlijk mijn hond van gemengd ras, Otto, laten testen – weet je, gewoon omwille van de journalistiek! Maar welke test moeten we bestellen, bij welk bedrijf? We besloten snel om het meest uitgebreide product te bestellen bij elk van de twee toonaangevende bedrijven en de resultaten te vergelijken.

Otto had een afspraak met een dierenarts, die ik gebruikte als een kans om zijn bloed te laten afnemen voor het Mars Veterinary Wisdom Panel. We volgden het normale protocol:ik betaalde de dierenarts voor de bloedafname en de test; zijn personeel stuurde het monster naar het laboratorium en gaf me een test-ID-nummer zodat ik de voortgang van de test kon controleren via de Wisdom Panel-website.

De volgende dag nam ik Otto mee naar PETCO om een ​​testkit te kopen voor MMIG's Canine Heritage "XL" -test (dit bedrijf is sindsdien gekocht door Wisdom Panel). Het personeel van de verzorgingsafdeling van PETCO is door MMIG getraind om wanguitstrijkjes te verzamelen. Na de reis naar de dierenarts de vorige dag, was Otto nerveus, dus ik verzamelde het wanguitstrijkje zelf (maar vroeg een PETCO-medewerker om te poseren met het monster en de bijbehorende envelop, weet je, voor de wetenschap).

DNA-test spanning

Wachten op resultaten was ondraaglijk 7, vooral omdat Canine Heritage me een e-mail stuurde de dag nadat ik het wanguitstrijkje op de post had gedaan, ter bevestiging van de ontvangst in het laboratorium in Davis, Californië (ik woon ongeveer 70 mijl van Davis). Dit gaf me het idee dat ik misschien binnenkort resultaten zou ontvangen - maar het duurde zeven volle weken om ze per post te ontvangen! (MMIG zegt dat de resultaten binnen zes tot acht weken zouden moeten arriveren; het was gewoon de anticipatie die dit wachten eindeloos maakte. Plus het feit dat je de resultaten niet online kunt krijgen.) Ik controleerde de website elke dag voor de resultaten van het Wisdom Panel. Slechts drie weken nadat Otto zijn bloed had laten afnemen, zag ik dat de resultaten compleet waren en kon ik het Adobe Acrobat-bestand downloaden dat ze bevatte.

Dus? Wat is Breed is Otto?

De resultaten van het Wijsheidspanel zeiden:"Uit de analyse bleek dat Otto een redelijk gemengde hond is en we hebben geen bewijs gevonden van een raszuivere ouder of grootouder." (Ik denk dat ik dat wist!) Er waren geen resultaten op het niveau 'Aanzienlijk' of 'Gemiddeld'. Echter, op het “Minor” niveau verschenen deze vier rassen:Duitse Herdershond, *Basenji, *Chow Chow en *Border Collie. De sterretjes gaven aan:'Kleine hoeveelheid gedetecteerd bij lage betrouwbaarheid. Deze resultaten worden niet meegenomen in nauwkeurigheidsberekeningen.” (Ik:"Basenji?!")

De resultaten van Canine Heritage lieten niets zien in de categorie 'Primair', Chow Chow in de categorie 'Secundair' en Poedel en Border Collie 'In the Mix'. (Ik:"POEDEL?!")

Mijn verwachtingen

Ik had geraden dat Otto een Duitse herdershond in zich had, en ik verwachtte zelfs wat Chow Chow. Hij heeft beslist een GSD-achtige staart en zijn oren zijn erg Chow. Als hij kletsnat is en zijn haar glad is, lijkt zijn lichaamsvorm een ​​beetje op een Golden Retriever. En ik was er zeker van dat er een terriërras in hem moest zitten. Hoe verklaar je anders dat fuzz-gezicht?

Het asiel waar ik hem uit adopteerde vermoedde dat hij Airedale en Border Terrier was. (Ik geef ze een pauze; hij was pas ongeveer vijf maanden en klein toen ze hem kregen.) Hoewel dit ras niet voorkomt in de Canine Heritage of Wisdom Panel-database, was auteur Lisa Rodier op zoek naar een Picardische herder (Berger Picard) resultaat; ze denkt dat hij een bel is voor de Winn-Dixie-hond. Niemand raadde Border Collie, Poedel of Basenji.

Waarom werkten de DNA-tests niet?

Hoe kunnen de twee bedrijven zulke verschillende resultaten hebben voor Otto?

We hebben Theresa Brady, woordvoerster van MMIG, gevraagd om deze vraag te beantwoorden. Ze antwoordde:"Elk bedrijf heeft zijn test onafhankelijk ontwikkeld, dus er zijn een aantal factoren die ertoe kunnen leiden dat verschillende rassen bij een bepaalde hond worden herkend. Tijdens de onderzoeksfase moet elk bedrijf een set DNA-merkers identificeren die de verschillen van ras tot ras kenmerken. Dan moeten deze markeringen worden gekarakteriseerd in een reeks honden die de zuivere rassen vertegenwoordigen.

"Niet alleen zijn deze markeringen verschillend tussen bedrijven, maar het aantal en de bron van de rashonden zijn ook verschillend. Geen enkel bedrijf kan elke raszuivere hond testen die een ras vertegenwoordigt, en elk bedrijf zal software hebben ontwikkeld die wordt gebruikt om deze genetische markers tussen rassen te vergelijken.

“Sommige rassen zijn echter nauw verwant omdat ze zijn ontstaan ​​uit het kruisen van oudere, meer gevestigde rassen. Boston Terriers zijn bijvoorbeeld ontwikkeld uit de kruising van de Engelse Bulldog en de Engelse White Terrier. So, depending on the software program, the markers established for the purebreds and the population of breeds in each company’s database, the same dog may test ‘Boston Terrier’ with one company and ‘English Bulldog’ with another.

“Some breeds are related because they arose from a common lineage, such as many of those breeds developed from Asia. Early on, we (MMIG) recognized that the Chow Chow, the Akita, the Siberian Husky, the Chinese Shar-Pei, and even the Shih-Tzu can cluster together as one general breed type so we developed an enhanced program and analysis procedure to split these apart. Thus it is not surprising that the companies may report slightly different results, especially for the breeds that have just a small representation in the mixed breed pet.”

Addressing any results that appear in the “Secondary” section of a report (where they detected Chow Chow in Otto), the MMIG (Canine Heritage) results packet says, “This category reports breeds that might be easily recognizable within your dog. While these breeds may or may not have a strong influence on your pet, each breed listed makes up less than the majority of your dog’s DNA.”

Addressing results that appear in the “In the Mix” section of a report (where they detected Poodle and Border Collie in Otto), the Canine Heritage packet says, “This final category identifies breeds that have the least amount of influence on your pet’s composition. They still appear, at low and measurable amounts, in your pet’s DNA. If your pet’s results only identify breeds in this category, it is possible your pet is composed of so many breeds only small influences from each breed can be detected.”

The Mars Veterinary (Wisdom Panel) results packet explains, “Because of the complexity of genetics and the passing on of dominant and recessive genes from generation to generation, every trait from the breeds we found may not always be visually apparent. It is important to spend time closely observing Otto’s appearance and personality. Think about which of Otto’s traits may reflect a combination of the breeds detected, and which seem to reflect just one of the individual breeds.”

Our Opinion on Breed Testing

I have to say that I found the whole exercise very interesting, but not necessarily worth the cost. Given that the results for my very mixed-breed dog were so weak, the idea that they might help me anticipate certain health or behavior problems linked to the breeds found is not very compelling. But I doubt that’s why most people order the tests; I think most of us are just curious.

Having spent so much time examining and admiring the technological achievements that went into the development of these DNA tests, Lisa Rodier was afraid I would pooh-pooh the science behind these tests because I was so skeptical of the breeds detected in Otto’s lineage. It’s not that; I trust the science. I believe there are traces of these breeds (and many others) in Otto. It’s just that I already knew he was a very mixed dog, just from a (free!) look at him. And if he wasn’t such a mixed bag – if he looked a lot like one particular breed, I’d probably be satisfied with the idea that he was mostly that breed; I wouldn’t spend $100-plus to confirm it.

That said, I must admit I will be interested to see how the results might change in a few years, after these companies put thousands and thousands more dogs into their databases. Which breeds will “fall off” of Otto’s results as meaningless “background noise”? Will the Picardy Shepherd be added? It could still develop that Otto is a limp-eared Picardy who fell out of a French tourist’s car somewhere in the Northern California wine country…We’ll check back with these companies in a few years, and let you know.

– Nancy Kerns

Dog DNA Testing FAQs

Canine mixed breed tests seem to be a very emotional topic. Those who have used the tests and have gotten the results they expected tend to be proponents, while those who received weak results or results that didn’t seem to square with the dog’s appearance tend to regret the purchase. But does that mean the tests don’t work? Here’s a stab at trying to explain some of what might be going on.

Breed results are reported in levels; Why is my dog only getting “minor” or “trace” breeds and no strong hits?

Dr. Hughes explained that most likely the dog’s parents and grandparents were themselves mixed breed, and a portion of the dog’s ancestry can be mixed beyond three generations which, for Mars Veterinary, is the extent of the company’s confidence. There is also the possibility that a breed is not covered in the database (for example, none of the tests’ databases include Rat Terrier) so the test will look for the most closely related breed.

My dog looks like X, but the test says she’s Y…

Dr. Hughes explains that we want to associate a particular trait with one breed, but in actuality, it could be coming from a number of breeds. And when we move across breeds, combinations of genes can create very unusual outcomes.

One way she looks at the issue is first looking at a dog’s traits, defining what genes are necessary to get those traits, and then asking whether we can get those genes in a particular breed? For example, the merle color pattern, very common in Australian Shepherds, comes from a single gene, and a dog need only have one copy of that gene to exhibit that color pattern, And guess what? Dachshunds, Chihuahuas, and Great Danes can all provide that gene.

Black and tan coats are commonly associated with Rottweilers and Dobermans. But Chihuahuas, Cocker Spaniels, Dachshunds, and Poodles all carry this gene mutation. But in this case, it is recessive, so two copies must come together for

us to actually see that color pattern.

Meg Retinger of BioPet also points out that in some very mixed dogs, you might only see very subtle traits, such as the shape of the ear or the eyes. Her son’s dog tested as showing Beagle, yet she looks very much like a Labrador. When she howls, however, she sounds like pure Beagle!

My dog is a Labradoodle (Labrador Retriever-Poodle cross), so why doesn’t the test say she’s a 50/50 mix?

We let Theresa Brady of MMIG address this, as she herself owns a Labradoodle. When she tested her dog using the Canine Heritage test, the results showed that Poodle was a Secondary breed, with Labrador Retriever “In the Mix.”

She explains, “You should know that my dog came from a breeder who claimed that the dog was seventh generation Labradoodle, which means that neither of her parents was a purebred (purebred Poodle or Retriever) and neither of their parents were purebred and so on. It makes sense, then, that she had nothing show up in Primary.” When I asked why the Poodle was Secondary, but not the Retriever, her guess was that the breeder probably crossed back more Poodle, looking for a more hypoallergenic coat. Dr. Hughes adds, “When breeding Labradoodle to Labradoodle, the “amount’ of Lab or Poodle genes passed down is random chance (think of a Pachinko machine). Testing the dog’s littermates may show very different proportions of each of these breeds. That being said, some ‘Labradoodle’ breeders are back-crossing Labradoodles to Poodles to change the size or coat of the dogs. I have seen some really strange looking Labradoodles!”

How can dog DNA tests get better?

Increasing the size of the database, increasing the number of markers, and overall innovations in technology will see the tests become better tools. Also, as research continues on canine genetics, a better understanding of genes and how they relate to various breed traits will play a role in making a better test.

Lisa Rodier lives in Alpharetta, Georgia, with her husband and two Bouviers.