Aussiedoodles kunnen worden beïnvloed door de volgende (maar niet beperkt tot) gezondheidsproblemen en ziekten, waarvan sommige erfelijk zijn. Het zijn niet allemaal risicovolle gezondheidsproblemen en ziekten voor Aussiedoodles. Sommigen van hen zijn omgevingsziekten en kunnen dus gemakkelijk worden vermeden door Aussiedoodles de juiste zorg en aandacht te geven.
