Cockapoos kan worden beïnvloed door de volgende (maar niet beperkt tot) gezondheidsproblemen en ziekten, waarvan sommige erfelijk zijn. Het zijn niet allemaal risicovolle gezondheidsproblemen en ziekten voor Cockapoos. Sommigen van hen zijn omgevingsziekten en kunnen dus gemakkelijk worden vermeden door Cockapoos de juiste zorg en aandacht te geven.