Keep Pet >> Huisdier >  >> honden >> Gedrag

Honden-DNA-tests:gemengde resultaten

Op een prachtige lentedag in Montana was ik op weg terug van een ravotten in de bergen met mijn drie honden toen we uit het bos een weide instapten, vol met zangvogels en een paar open koeien die vredig grazen. Mijn padgenoten ontdekten al snel, tot hun grote vreugde, verse, heerlijke koeientaarten.

Het kwam echter bij me op dat ik de MDR1-status (multi-drug resistance gen) van het nieuwste lid van mijn drie-hondencrew, Hap, niet kende. MDR1 is een genetische aanleg voor bijwerkingen van geneesmiddelen op meer dan een dozijn veel voorkomende diergeneesmiddelen, en het gen wordt voornamelijk aangetroffen bij hoedende rassen. Hap lijkt voornamelijk een Border Collie te zijn met misschien, heel misschien, een snufje Australian Shepherd, dus deze aanleg zou hem in deze situatie in gevaar kunnen brengen. Koeien krijgen vaak ivermectine als antiparasitair middel en het medicijn kan kort daarna in hun uitwerpselen worden gevonden; het eten van deze uitwerpselen kan een dodelijke reactie veroorzaken bij een hond met de MDR1-mutatie. Dus ik stelde een moratorium in op het proeven van de taart van de middag, tot groot ongenoegen van mijn bemanning, en we wandelden de zonsondergang in.

Toen we thuiskwamen en informatie over MDR1-testen begon op te zoeken, kwam ik erachter dat veel van de genetische tests voor het typeren van rassen nu ook genetische gezondheidsschermen bevatten, waaronder testen op de MDR1-mutatie. Ik dacht, waarom niet het mysterie van Hap's rassenmix oplossen en tegelijkertijd gezondheidsinformatie krijgen? Het klonk leuk!

Honden-DNA-tests:gemengde resultaten

Hoe werken DNA-tests bij honden?

Terwijl sommige van de vroege identificatietests voor gemengde rassen een bloedmonster gebruikten, extraheren alle producten die tegenwoordig op de markt zijn DNA uit cellen die door de eigenaar van de hond zijn uitgeveegd vanaf de binnenkant van de wang van de hond. Het wattenstaafje wordt verzegeld in een door het bedrijf verstrekte container en naar het laboratorium van het bedrijf gestuurd. Daar halen technici het DNA van uw hond uit het uitstrijkje en gebruiken ze computers om specifieke stukjes ervan te identificeren en te vergelijken met stukjes van honden van bekende afstamming.

Het genoom van een hond bevat ongeveer 2,5 miljard nucleotiden (de bouwstenen van DNA); onderzoekers richten zich op "slechts" ongeveer 200.000 van deze individuele genen - of beter gezegd, microsatellieten of zich herhalende DNA-sequenties die single-nucleotide polymorphisms (SNP's, uitgesproken als "snips") worden genoemd en die kenmerkend zijn voor verschillende rassen.

Onderzoekers moeten voldoende SNP's hebben van voldoende raszuivere vertegenwoordigers van elk ras om een ​​adequate reeks SNP's te hebben waarmee ze de SNP's van uw hond kunnen vergelijken. Hoe groter de database van het bedrijf met monsters van rashonden, hoe beter. Wanneer een bedrijf er absoluut niet in slaagt om voorouders van kandidaatrassen te suggereren die in de verste verte waarschijnlijkheid zijn, is het waarschijnlijk dat het niet genoeg rassen in zijn databanken heeft om goede overeenkomsten te vinden voor de SNP's van uw hond.

Bedrijven die DNA-tests van gemengde rassen aanbieden

DNA mijn hond

DNA Mijn hond Hondenras Identificatietest , $69. Identificatie van 92 rassen.
DNA My Dog Breed-test plus Wolf-Coyote hybride test , $89.
DNA-rasidentificatietest plus volledige genetische screening , $189. Gezondheidsscreening identificeert meer dan 100 ziekten.

Betreed Veterinary, Inc.

Begin DNA-test voor honden , $199. Identificatie van meer dan 175 rassen en meer dan 160 ziekten. "We testen 20 keer meer genen van uw hond dan andere DNA-tests voor honden."

Wijsheidspanel

Detectie van hondenrassen , $85. Identificatie voor meer dan 250 rassen, plus MDR1 en inspanningsgeïnduceerde collaps (EIC) screening voor drugs- en inspanningsgevoeligheden.
Detectie van hondenras Plus-ziekte , $150. Identificatie voor meer dan 250 rassen, plus MDR1 en inspanningsgeïnduceerde collaps (EIC) screening, plus geavanceerde gezondheidsscreening voor meer dan 150 genetische gezondheidsproblemen.

Als het uiterlijk van uw hond bedriegt

Dat gezegd hebbende, wanneer honden van verschillende afkomst zich voortplanten, kunnen de resulterende pups visueel volledig op andere rassen lijken - maar de genetische handtekeningen die van hun ouders zijn geërfd, zijn veelzeggender dan het meest hondenbewuste oog. Neem bijvoorbeeld Clara. Clara is een asielreddingshond, geadopteerd als een jonge volwassene, waarvan werd aangenomen dat ze voornamelijk een Labrador was, met iets meer middelgroots in de mix. Haar eigenaren, Gianna en Kip Savoie, vermoedden dat ze ergens in haar afstamming een herdersras had, gezien veel Border Collie-achtige gedragskenmerken die ze hadden gezien.

Honden-DNA-tests:gemengde resultaten

Ze stuurden een uitstrijkje van haar wang naar Embark voor analyse. Wat terugkwam, was grotendeels wat ze hadden vermoed:Labrador Retriever, een scheutje Border Collie, maar met een paar kleinere verrassingen en een hele grote. Deze kortharige zwarte hond werd in feite uitgeroepen tot meer Golden Retriever (38 procent!) dan wat dan ook.

Op basis van de scherpste visuele beoordeling lijkt dit misschien een fout, maar het is in feite zeer haalbaar.

Golden Retrievers dragen een zwart gen dat tot uiting komt in hun neus, de voetzolen, hun glamoureuze dikke zwarte eyeliner, maar niet in hun vacht. Het zwart wordt geblokkeerd door het gele gen, dat recessief is, net als hun karakteristieke luxe lange lokken. Een Golden Retriever gefokt met een hond zonder genen voor gele kleur en lange vacht, zoals een zwarte Labrador, zou daarom resulteren in een zwarte hond met een korte vacht - een hond die veel op Clara lijkt.

Enkele raadselachtige DNA-resultaten van honden...

Aan het meer komische einde van het spectrum, werd Hap, mijn vrolijke, hoppige, vliegende Border Collie / mysterieras-kruising door Wisdom Panel verklaard tot 88 procent Border Collie en 12 procent - hier klaar voor? - Boston terrier! Ik heb in mijn 20 jaar dat ik hier in Montana woon nog nooit een Boston Terrier gezien die doordrenkt is van alles wat met honden te maken heeft, en dit leek me hoogst onwaarschijnlijk.

Aangezien ik in een landelijke, ranch-zware omgeving woon en het asiel waar ik deze kerel heb gekocht klein is en meer een herdershondenredding dan een algemeen open-deur-asiel is, had ik moeite om me voor te stellen waar de genen van Boston Terrier mogelijk vandaan zouden kunnen komen . Aan de andere kant is Hap absoluut de meest speelse, gezellige hond die ik ken en deze kwaliteiten passen bij het persoonlijkheidstype van de Boston Terriers die ik heb ontmoet, dus misschien. Misschien was er een Casanova uit Boston die op het juiste moment een ranch bezocht. Er kunnen vreemde dingen gebeuren.

Maar soms testen de resultaten de grenzen van goedgelovigheid. Neem als voorbeeld de resultaten die door DNA My Dog zijn teruggestuurd uit een monster van Otto, een zeer gemengd rashond die toebehoort aan de redacteur van WDJ, Nancy Kerns. Otto is door verschillende bedrijven getest (zie 'Otto's resultaten' hieronder). De twee bedrijven met de grootste rassendatabases leverden redelijk vergelijkbare resultaten op. Maar DNA My Dog, een veel kleiner bedrijf, leverde resultaten op die niet alleen volledig verschilden van de resultaten van de twee grotere bedrijven, maar ook ongelooflijk onwaarschijnlijk waren. Het is zeer onwaarschijnlijk dat de voorgestelde rassen aanwezig zijn in het geografische gebied van herkomst van Otto, en nog minder waarschijnlijk in de geïdentificeerde combinatie.

Als DNA-resultaten van honden niet kloppen

De bedrijven die deze service aanbieden, hebben een paar standaardverklaringen voor resultaten die niet logisch lijken.

Geen van de bedrijven zou toegeven dat hun referentiedatabases niet voldoende groot zijn om de SNP's van uw hond nauwkeurig te identificeren, maar ze zouden kunnen suggereren dat dit waar zou kunnen zijn voor hun concurrenten.

Alle bedrijven zullen snel uitleggen dat er honderdduizenden genen zijn die verantwoordelijk zijn voor het uiterlijk van een hond, en dat veel rassencombinaties resulteren in honden die er heel anders uitzien dan je zou verwachten van die mix van rassen.

Bovendien combineren genen in gemengde rassen niet altijd op dezelfde manier binnen alle nestgenoten, dus grootte en fysieke en gedragskenmerken in hetzelfde nest van pups kunnen en zullen vaak variëren, soms wild.

Ze leggen ook uit dat de complexiteit van de mix van uw hond de nauwkeurigheid van de resultaten zal beïnvloeden. Kruisingen van de eerste generatie tussen twee raszuivere ouders zijn relatief eenvoudig te identificeren, maar honden die binnen verschillende generaties geen raszuivere voorouders hebben, zijn veel moeilijker met veel zekerheid te identificeren, aangezien de lengte van de erfelijke SNP's die uniek zijn voor rashonden, wordt veel korter bij elke generatie gemengde nakomelingen.

Problemen met identificatie kunnen ook optreden wanneer er veel divergentie is binnen een specifiek rastype, zoals in het geval van Australian Shepherds en Border Collies, waar je veldgefokte lijnen en showgefokte lijnen hebt. De genetische handtekeningen in de databases van de bedrijven komen meestal overeen met gefokte lijnen, dus in het veld gefokte Aussies en BC's kunnen zelfs aan een ander ras worden toegewezen.

Zowel Embark als Wisdom Panel maken het voor consumenten gemakkelijk om contact met hen op te nemen en vragen te stellen over de resultaten van hun honden. Ik belde en vroeg een vertegenwoordiger van Wisdom Panel om de resultaten van Hap met mij door te nemen en kreeg te horen dat het statistische vertrouwen in de bevinding van Boston Terrier marginaal was, wat betekent dat er een grote kans is dat dit resultaat niet correct is. Hap zou 12 procent kunnen hebben van iets dat niet vertegenwoordigd is in de Wisdom Panel-database (zoals in het veld gefokte Australian Shepherds), maar aangezien deze unieke handtekening momenteel niet in de database bestaat, werd hij toegewezen aan het ras met de meest overeenkomende genetische handtekening. Er is mij verteld dat er updates zullen worden aangebracht in het rapport van Hap wanneer nieuwe informatie aan de database wordt toegevoegd.

Welke DNA-test voor honden is het beste?

Van de beschikbare merken lijken Embark en Wisdom Panel het meest transparant te zijn over hun methodologieën en over de informatie die beschikbaar is in hun databases. Beiden brengen hun producten regelmatig bij, terwijl ze ook toegankelijk zijn om vragen van consumenten te beantwoorden. Hierdoor stijgen ze allebei naar de top in mijn boek. Houd er echter rekening mee dat de basis Wisdom Panel 4.0-rasdetectietest minder dan de helft van de prijs van de Embark-test kost.

Andere bedrijven, zoals DNA My Dog, hebben een relatief kleine database met 92 rassen, er is zeer weinig informatie beschikbaar over hun methodologie, en ik vond het zelfs moeilijk om contactgegevens te vinden om vragen te stellen.

Terwijl commerciële genetische rassentypering nog steeds in ontwikkeling is, is het interessant en belachelijk leuk, wat iets waard is. Meer bedrijven bieden ook genetische gezondheidsschermen aan, die nuttig kunnen zijn voor de langdurige gezondheidszorg van uw hond. Veel ervan is misschien niet van toepassing op uw specifieke viervoeter, dus voordat u het geld uitgeeft, moet u uw dierenarts raadplegen om erachter te komen wat zij of hij aanbeveelt.

Otto's resultaten

De resultaten van Otto zijn de afgelopen acht jaar veranderd, waarbij de onwaarschijnlijke Basenji is verdwenen en een bullebak en een Australian Cattle Dog in de mix verschijnen. Merk op dat de resultaten van de twee toonaangevende testaanbieders van gemengde rassen behoorlijk vergelijkbaar zijn - en dat de resultaten van het kleinste bedrijf dat deze service aanbiedt, grenzen aan fantasie. (Die rassen zijn hoogst ongebruikelijk in het gebied van herkomst van Otto en zouden zelfs nog zeldzamer worden gezien bij dezelfde hond.)

2009:Wijsheidspanel

Duitse herder
Basenji
Chow Chow
Bordercollie

2016:DNA My Dog

Niveau 3 (20%-36%):Collie, Nova Scotia Duck Tolling Retriever
Niveau 4 (10%-20%):Engelse setter, Noorse elandhond

2016:Wijsheidspanel

12,5% Amerikaanse Staffordshire Terriër
12,5% Australische veedrijvershond
12,5% Bordercollie
12,5% Chow Chow
12,5% Duitse herdershond
37,5% (gemengd)

2018:aan boord

21,3% Amerikaanse pitbullterriër
14,1% Australische veedrijvershond
13,2% Duitse herdershond
12,3% Chow Chow
10,3% Labrador Retriever
8,0% Bordercollie
4,3% Rottweiler
16,5% ("Supermutt")

Kathryn Socie-Dunning woont met haar man en drie honden in Montana.