De Pyreneeën kunnen worden aangetast door de volgende (maar niet beperkt tot) gezondheidsproblemen en ziekten, waarvan sommige erfelijk zijn. Het zijn niet allemaal risicovolle gezondheidsproblemen en ziekten voor de Pyreneeën. Sommigen van hen zijn omgevingsziekten en kunnen dus gemakkelijk worden vermeden door de Pyreneeën de juiste zorg en aandacht te geven.
