Portugese waterhonden kunnen worden beïnvloed door de volgende (maar niet beperkt tot) gezondheidsproblemen en ziekten, waarvan sommige erfelijk zijn. Het zijn niet allemaal risicovolle gezondheidsproblemen en ziekten voor Portugese waterhonden. Sommigen van hen zijn omgevingsziekten en kunnen dus gemakkelijk worden vermeden door Portugese waterhonden de juiste zorg en aandacht te geven.
