Shiba inus kan worden beïnvloed door de volgende (maar niet beperkt tot) gezondheidsproblemen en ziekten, waarvan sommige erfelijk zijn. Het zijn niet allemaal risicovolle gezondheidsproblemen en ziekten voor Shiba-inus. Sommigen van hen zijn omgevingsziekten en kunnen dus gemakkelijk worden vermeden door Shiba inus de juiste zorg en aandacht te geven.
