Het is vaak moeilijk om het geslacht van een huisdierenschildpad te bepalen, vooral als je hem niet hebt gekocht bij een fokker die ze heeft uitgebroed in omgevingen met gecontroleerde temperatuur. De temperatuur tijdens het broeden van eieren bepaalt of een embryo een mannetje of een vrouwtje wordt; koelere incubatietemperaturen produceren mannetjes en vrouwtjes ontwikkelen zich bij warmere temperaturen.
Gelukkig zijn er sommige soorten schildpadden die het gemakkelijker maken dan andere om een mannetje van een vrouwtje te onderscheiden zonder hun incubatietemperatuur te kennen. Roodwangschildpadden laten bijvoorbeeld seksueel dimorfisme zien en hebben duidelijke verschillen in grootte en uiterlijk tussen de geslachten.
De verschillen in grootte tussen de meeste mannelijke en vrouwelijke schildpadden zijn misschien niet duidelijk totdat de schildpadden geslachtsrijp zijn (en het dieet kan ook een rol spelen in de grootte van een schildpad). Voor mannelijke roodwangschildpadden is geslachtsrijpheid ongeveer de tijd dat ze 4 inch lang worden (en ongeveer twee tot vijf jaar oud). Vrouwtjes zijn geslachtsrijp wanneer ze 6 tot 7 inch lang worden (wat vijf tot zeven jaar kan duren). Vrouwtjes zullen groter worden dan mannetjes in roodwangschildpadden en vele andere soorten schildpadden, maar het verschil in grootte tussen mannetjes en vrouwtjes verschilt per soort. Bij sulcata-schildpadden kunnen de vrouwtjes bijvoorbeeld 100 pond bereiken en de mannetjes kunnen groeien tot 200 pond of meer. Bij zeeschildpadden kunnen het mannetje en vrouwtje allebei even groot worden. Om de schaalgrootte betrouwbaar te gebruiken als factor bij het bepalen van het geslacht van een schildpad, moet de schildpad zijn volwassen grootte hebben bereikt.
De onderkant van het schild van een schildpad (de plastron genoemd) wordt ook gebruikt als indicator voor het bepalen van het geslacht bij schildpadden. Mannelijke schildpadden hebben een hol (gebogen) plastron, terwijl vrouwtjes een platte hebben. Deze vormen zorgen ervoor dat mannelijke schildpadden gemakkelijker een vrouwtje kunnen bestijgen tijdens het paren, en ze geven vrouwtjes meer ruimte om inwendig eieren te houden.
Vrouwelijke schildpadden hebben vaak klauwen aan hun voorpoten die kort en gedrongen zijn. Mannetjes (en met name roodwangschildpadden en andere waterschildpadden) hebben veel langere klauwen aan hun voorpoten dan vrouwtjes. Dit komt omdat mannetjes hun klauwen gebruiken wanneer ze proberen vrouwtjes te lokken om te broeden. Tijdens het paren grijpen de mannetjes ook de bovenste schelpen van het vrouwtje met hun lange klauwen.
De meest gebruikelijke manier om het geslacht van een schildpad te bepalen, is door naar de lengte van zijn staart te kijken. Vrouwelijke schildpadden hebben korte en dunne staarten, terwijl mannetjes lange, dikke staarten hebben, met hun opening (cloaca) dichter bij het einde van de staart. staart in vergelijking met een vrouwtje. Het is natuurlijk het gemakkelijkst om het geslacht van een schildpad te bepalen als je naar de staartlengte kijkt als je meerdere schildpadden van beide geslachten hebt om te vergelijken.
Alle roodwangschildpadden hebben overwegend groene lichamen met felgele strepen, wat niet helpt om mannetjes van vrouwtjes te onderscheiden. Maar andere kleurindicatoren kunnen dat wel. Het plastron is geel met ongelijke, donkere markeringen die gepaard gaan, terwijl de staart, poten en kop groen zijn met dikke gele strepen. Naarmate roodwangschildpadden ouder worden, veranderen velen in een donkere, bijna zwarte kleur en kunnen sommige of al hun gele markeringen verdoezelen. Deze donkerdere kleur komt vaker voor bij mannelijke roodwangschildpadden.
Sierlijke doosschildpadden zijn een ander soort schildpad die seksueel dimorf is. Volwassen mannelijke sierlijke doosschildpadden hebben rode ogen, terwijl vrouwelijke ogen bruin of geel zijn. De mannetjes hebben ook groenachtige koppen met rode of oranje pootschubben en vrouwtjes hebben bruine koppen met gele pootschubben.
